انجمن قارچ‌شناسی ایران در ابتداء به صورت شاخه‌ای در انجمن بیماری‌شناسی گیاهی ایران (نامه شماره 83 مورخ 4/8/77 انجمن بیماری‌شناسی گیاهی ایران) فعال بوده است و سپس تاسیس آن تحت عنوان ًانجمن علمی قارچ‌شناسی ایرانً در تاریخ 1/12/1388 مورد تایید کمیسیون انجمن‌های علمی ایران قرار گرفت و در تاریخ 18/12/1389 تحت شماره 27124 و شناسه ملی 10320496758 در اداره کل ثبت شرکت‌ها و موسسات غیرتجاری به ثبت رسید.

اهداف کلی: انجمن قارچ‌شناسی ایران که موسسه‌ای غیرانتفاعی است، شامل گسترش، پیش‌برد، ارتقاء سطح علمی، توسعه کیفی نیروهای متخصص و بهبود بخشیدن به امور آموزشی و پژوهشی در زمینه‌های قارچ شناسی در ایران می باشد. زمینه‌های مورد حمایت انجمن کلیه امور در رشته‌های مختلف (از قبیل قارچ‌شناسی، زیست‌شناسی، بیماری‌های گیاهان، گیاه‌پزشکی، صنایع غذائی، تولیدات قارچ‌ها، بیوتکنولوژی صنایع شیمیائی و غیره) که به نحوی از انحناء با دانش قارچ‌شناسی ارتباط دارند.

اعضای انجمن را متخصصانی تشکیل می‌دهند که به نحوی با دانش قارچ‌شناسی در ارتباط می‌باشند. این اعضاء مطابق با فصل سوم اساسنامه انجمن به صورت: عضو پیوسته، عضو وابسته، عضو دانشجوئی، عضو افتخاری و عضو موسسه‌ای (حقوقی) با انجمن مرتبط می‌باشند.

انجمن سالانه (معمولاً در شهریور ماه) مجمع عمومی برگزار می‌کند و هر سه سال یک بار در مجمع عمومی اقدام به انتخاب هیات مدیره خود می‌کند.

انجمن دارای دو نشریه است:

1-    هاگ (خبرنامه) که به صورت فصلنامه و به زبان فارسی انتشار می‌یابد.

2-  Mycologia Iranica (قارچ‌شناسی) که به صورت فصلنامه و به زبان انگلیسی منتشر می‌شود.